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清华新闻网6月5日电NPC(核孔复合体)是细胞内最庞大、最复杂的分子机器之一,是介导生物大分子进行核质转运的唯一通道,参与细胞内众多重要的生命活动,其功能的紊乱能够引起包括癌症在内的多种严重的疾病。近年来,通过整合冷冻电镜技术、X射线晶体学、质谱学和人工智能等技术,NPC的三维结构正在逐步得到解析。然而,关于其核质转运的分子机制仍然是不清楚的。核糖体是NPC转运的最具代表性的生物大分子组装体之一,负责合成生命的基础物质——蛋白质分子。核糖体的生物合成涉及200多个组装因子的参与,是一个高度有序的调控过程。核糖体在成熟之前,其大小亚基的组装首先起始于核仁区域,随后在核仁和核质中经过一系列的加工过程,经由NPC转运至细胞质中完成最后的成熟。近年来,科学家们已经报道了许多核糖体前体的高分辨结构,几乎涵盖了细胞核和细胞质组装阶段的主要步骤。然而,目前仍缺乏核糖体前体在NPC核质转运过程中的关键结构,这极大地阻碍了我们对核糖体在细胞内成熟过程的理解。
5月31日,南方科技大学生命科学学院、冷冻电镜中心,清华大学生命科学学院隋森芳院士团队在国际顶尖期刊《自然》(Nature)上发表了题为“核糖体前体大亚基通过核孔复合体的出核转运”(Nuclear export of the pre-60S particles through nuclear pore complex)的最新研究成果,该成果解析了处于NPC孔道内核糖体前体(pre-60S)的高分辨结构,展示了pre-60S通过NPC孔道过程中构象和组成变化,阐述了NPC协助pre-60S进行出核转运的分子机制,为进一步理解NPC转运生物大分子的生理功能提供了重要的理论依据。
不久前,隋森芳课题组利用冷冻电镜单颗粒技术解析了酵母NPC的结构,把酵母NPC的内环(Inner ring,IR)结构推进到近原子分辨率3.73埃,该工作是迄今为止酵母NPC内环的最详尽、最精确的结构模型。在此工作的基础上,隋森芳课题组近期在NPC内环的孔道里捕捉到被转运生物大分子颗粒的结构信息。综合运用生物化学和冷冻电子显微学的研究手段证明,处于NPC孔道内的生物大分子颗粒是核质转运过程中的核糖体前体pre-60S,并将pre-60S的结构分辨率解析到2.64埃(图1a-c)。通过大量的统计学分析,该结构第一次揭开pre-60S颗粒在通过NPC孔道时的行为特征。孔道中pre-60S的表面结合了迄今为止报道的几乎所有转运因子,说明pre-60S的出核转运是一个十分耗能且复杂的过程(图1c-d)。结构分析显示pre-60S在出核前后展现出明显的差异性,主要表现为如下特征:组成上展示出大量组装因子和转运因子的结合与解离;结构上在L1 stalk(L1茎)、H38(核糖体RNA螺旋38)、ES27(核糖体RNA扩展片段27)和PTC(肽基转移酶中心)区域也呈现出剧烈的构象变化(图2)。
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