新浪潮,空间转录组学技术已至风口
自2016 年空间转录组学技术第一次发布于 SCI顶级期刊《Science》 杂志,空间组学便成为了继单细胞测序技术之后的另一个生物技术研究热点。
空间转录组从空间层面对基因表达数据进行解析,利用基因芯片技术将样本位置信息保留在芯片上以此解析单个组织切片中的mRNA,从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的表达情况。
伴随着单细胞技术的发展,分析工具的拓展使得空间分析在过去一两年逐渐发展成为一个新的科研领域。空间转录组学技术更是先后被《Nature》、《Nature Method》评为 “年度技术”,其相关技术呈指数级增长,在给定的预测期内,全球单细胞与空间转录组分析市场预计在2026年将达到约77亿美元。
空间组学相关论文数量呈指数性爆炸增长 Nat Methods. 2022 Mar 10. doi: 10.1038/s4
近年来,空间转录组的研究逐渐受到广大研究学者的青睐,其不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息,同时还能定位其在组织中的空间位置。这对于癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究都有重要意义。
新突破,国内首款亚细胞级微孔空间芯片百创S1000正式上市
空间转录组芯片制造技术长期以来一直被国外公司垄断,国内无法生产如此高精度芯片。
4月20日,国内生物科技公司百迈客生物经过多年研发,正式发布了国内首款亚细胞级微孔空间转录组芯片:百创S1000。百创S1000的新品发布会现场云集学术专家、行业投资人以及媒体记者,一同见证百创S1000的诞生。
百创S1000让研究者们可以结合不同阶段图谱数据,获得全面的亚细胞级时空动态表达图谱,从而为疾病的诊断治疗及药物研发提供更有力的决策依据,相比目前国外空间转录组测序芯片精度提高了近400倍,同时还能拍摄高清HE染色图片。
国内首款亚细胞级微孔空间芯片百创S1000
会上,百迈客生物总裁郑洪坤先生对此款芯片进行了介绍。他表示,传统空间转录组测序技术由于分辨率较低,无法在胚胎生长发育、脑组织精细结构划分、肿瘤免疫微环境等领域得到很好的应用,随着人类对生命的不断探索,迫切需要绘制更高精度的时空基因图谱,这就需要更高精度的空间转录组测序芯片来完成实验。本次发布的“百创S1000空间芯片”最大的突破就是将空间分辨率降低至5μm,而传统的芯片制造还处于100μm的分辨率。
百迈客生物总裁 郑洪坤
中国科学院陈润生院士表示,百创S1000空间芯片的发布将加快生长发育问题的研究,特别是在早期发育阶段复杂结构的研究。此款芯片针对只有一层或几层细胞有明显的优势,另外对于肿瘤发生发展或肿瘤治疗过程中关于免疫微环境或免疫浸润的研究也是一大利好的消息。同时,百创S1000空间芯片将加速时空动态图谱的构建,特别是加速精细图谱研究领域,有利于打破行业垄断加速空间数据积累。
中国科学院院士 陈润生
国科嘉和投资管理有限公司总经理陈洪武表示,国际上目前对空间转录组技术表现过热,主要还是因为其潜在科研产出巨大,未来全球单细胞与空间转录组技术市场价值有待更好的挖掘。
本次百创S1000空间组学芯片的发布,标志着百迈客生物从科研服务商,往科研一体化解决方案迈进了一大步。国内很多高端实验室的试验设备对国外制造具有一定的依赖性,在生物医药领域的仪器检测设备等领域与国外具有较为明显的差距。因此,从国家层面到研究机构,都希望在这个领域有所突破、促进发展,在这种差距较大的情况下,百迈客推出国内首家亚细胞级微孔空间芯片百创S1000显得尤其宝贵。
期待更多的企业如同百迈客一般在不同局部各个击破,推进我国整体产业的快速提升,从而使国内市场支撑更多先进技术落地产业化,形成良好的正循环。
国科嘉和投资管理有限公司总经理陈洪武
中国科学院北京基因组研究所于军研究员谈到,空间转录组技术被多家期刊评为年度技术或最重要技术之一,其被广泛推捧是因为其将基因组学研究从原来的一维与二维提升至了三维,能将基因定位于三维空间上的具体位点,对发育与肿瘤等研究的解读将更加深入。
中国科学院北京基因组研究所研究员 于军
中国农业科学院王晓武 研究员谈到,目前空间转录组测序技术应用在植物研究领域的主要障碍是很多植物叶片很薄,而百创S1000这种高分辨率的芯片对于这种仅有层数较少的细胞叶片研究工作有着非常重要的价值。
中国农业科学院研究员 王晓武
华西医院生物治疗国家重点实验室陈路研究员表示:百创S1000空间芯片在肿瘤与免疫相互作用过程中,能获得免疫细胞在肿瘤中的分布情况,从而对药物治疗情况进行精准把握;或根据肿瘤微环境中marker基因的分布情况辅助诊断、用药指导。同时,空间转录组技术对脑科学或神经发育与再生等提供更精准的数据,从而为神经疾病的治疗提供新的可能。在发育方向,结合不同发育时期,空间转录组技术能够高速的完成时空动态图谱的绘制,从而为发育类疾病的治疗提供更加全面的数据。
华西医院生物治疗国家重点实验室研究员 陈路
新征程,百迈客持续探索生命未来
百迈客生物(Biomarker Technologies)于2009年5月成立,在近13年的发展历程中,百迈客致力于打造生物技术创新中心,树立生物产业标志企业,基于高通量测序和生物信息技术的开发与应用,拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块。主要服务于国内外的科研院校、研究所、独立实验室、制药公司、农业育种公司等机构,以及医疗卫生机构、公司客户和大众客户,目前,业务已覆盖全国30多个省、市、自治区及海外过个国家。
公司秉持着以人为本、注重创新发展的理念,组建了一支创新研发能力突出的人才队伍。其中,技术及研发人员近500人,硕士以上学历占60%以上,高级工程师及以上职称专家20多人,海外留学及创业人员10余人,专业研究领域涉及生物信息、生物技术、农学、医学、计算机及数理等多学科。公司科研成果成果层出不穷,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇,累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项,软件著作权近200项。
此次发布空间芯片百创S1000标志着百迈客生物突破国外垄断开启了国产化制造时代,对国内空间转录组学研究起到了推进作用。百创S1000的诞生为百迈客生物多年潜心研发画上了完满的句点,同时也作为坚实的里程碑为百迈客生物开启了全新的征程。
全球知名的 Genetic Engineering & Biotechnology News (GEN) 杂志在 40 周年之际采访了数十位 biotech 领域学界、产业界和商业界的专业人士,有多位专家提到了空间技术。Nanostring 的首席科学官甚至这样形容:空间多组学将是革命性的,它甚至在重要性上超过了下一代测序。GEN 的高级科学作家 Julianna LeMeiux 也称,下一波基于基因组的技术,如空间转录组学和 DNA 编写,都将引领各自的革命。
百迈客生物对于空间转录组学的研究仍在继续,秉持着生物科技创新服务社会、造福人民的企业使命,百迈客生物将持续迈进、探索生命未来!
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